Süsinikuühendite kujutamine

  • Miks on oluline teada aine ehitust?
  • Mida kirjeldab molekulimudel?
  • Mille poolest erinevad struktuurivalem ja molekulivalem?

Lõhnavad molekulid

Loodus on täis värve, maitseid ja lõhnu, mida inimesed vahetult kogevad. Iga sellise erilise omaduse taga on kindlad keemilised ühendid. Teadmised molekulide koostise ja kuju kohta võimaldavad mõista nende ühendite omadusi ja tihti isegi ennustada, kuidas organism neile reageerib. Kuna aatomid ja molekulid on nii väikesed, et neid pole võimalik vahetult tajuda, saab nende ehitust mõista ainult mudelite põhjal.

Isoamüülatsetaadi molekul annab lõhna näiteks banaanidele ja pirnidele

Molekulimudelid

Süsinikuühendid on enamasti molekulaarsed ehk molekulidest koosnevad ained. Tuntakse miljoneid süsiniku­ühendeid ja paratamatult on vaja neid kirjeldada ja uurida, kuna molekuli ehitus määrab aine omadused. Ometi on molekulid nii väikesed, et neid ei suudeta otseselt tajuda ega täpselt ette kujutada. Täna­päeva tehnika võimaldab aga määrata aatomi­tuumade ja elektronide keskmisi asu­kohti ruumis ning nii saab luua mudeleid. Aatomite paiknemist molekulis kirjeldavad molekulimudelid.

Aatomjõumikroskoop (AFM) võimaldab „näha“ molekulide struktuuri ja luua nende põhjal mudeleid

Kõige piltlikuma ülevaate molekuli ehitusest annab ruumiline molekuli­mudel, milles aatomeid kujutatakse osaliselt kattuvate värviliste keradena. Näiteks vesinik on harilikult valge, süsinik must (tumehall), hapnik punane ja lämmastik sinine kera. Kerade suurus on erinev, sest aatomitegi suurus erineb, ent värvid on kokku­leppelised ega oma füüsikalist tähendust.

Ruumiline molekulimudel (vasakul) ja kuul-pulkmudel arvutiprogrammis

Koolikeemias puututakse kõige enam kokku aga kuul-pulk­mudeliga. Sellises mudelis kujutavad värvilised kerad aatomeid ja pulgad nende vahel keemilisi sidemeid. Kuul-pulk­mudeliga saab kirjeldada keemiliste sidemete pikkust ja paiknemist. Samuti on seda lihtsam joonistada ja selle põhjal molekuli struktuuri kirjeldada.

Molekuli kuul-pulkmudel füüsiliselt (vasakul) ja arvuti­programmis

Kõik molekulimudelid on molekulide lihtsustatud kirjeldused ja jäävad paratamatult ebatäpseks. Isegi aatomite piirjooned on molekulis hägusad, mitte selgesti eristatavad nagu kuulidel molekuli­mudelis.

Tänapäeval uuritakse molekule sageli arvuti­simulatsioonide abil, millega saab kirjeldada molekuli struktuuri ja elektronide jaotumist molekulis väga täpselt. See võimaldab seletada ja ennustada molekulide reaktsiooni­võimet.

Molekul aatom­jõu­mikroskoobis (vasakul) ja selle kuul-pulk­mudel arvuti­programmis
  • Aatomeid kujutatakse osaliselt kattuvate keradena.
  • Aatomeid kujutatakse värviliste keradena.
  • Aatomeid kujutavate kerade suurus on erinev.
  • Kerade vahel olevad pulgad kirjeldavad keemiliste sidemete pikkust ja paiknemist.

Struktuuri­valem ja molekuli­valem

Molekulimudelid kirjeldavad küll hästi molekuli kuju ja struktuuri, ent neid ei ole mugav lugeda ega paberile kirjutada. Seetõttu kasutatakse molekulide struktuuri­valemeid. Struktuuri­valem näitab, kuidas aatomid on molekulis omavahel seotud ja millised keemilised sidemed neid ühendavad. Aatomeid tähistatakse vastava elemendi tähisega ning kovalentseid sidemeid kujutatakse kriipsudena aatomite vahel.

Molekuli kuul-pulk­mudel arvuti­programmis (vasakul) ja struktuuri­valem (paremal)

Ühe elektronpaari moodustatud üksiksidet tähistatakse aatomite vahel ühe kriipsuga. Süsiniku­ühendites võib aatomite vahel esineda ka kaksik- ja kolmik­sidet. Kaksik­sideme moodustab kaks elektron­paari aatomite vahel ja seda tähistatakse kahe kriipsuga, kolmik­sideme moodustab kolm elektron­paari ja seda tähistatakse kolme kriipsuga.

Üksiksidet aatomite vahel tähistatakse ühe kriipsuga, kaksik­sidet kahe kriipsuga ning kolmik­sidet kolme kriipsuga

Tuleb meeles pidada, et struktuuri­valem ei kirjelda molekuli tegelikku kolme­mõõtmelist struktuuri.

Kõige lihtsam on molekulide koostist kirjeldada molekuli­valemi kaudu. Molekuli­valem näitab, millistest keemilise elemendi aatomitest molekul koosneb (elementide tähised) ja mitu iga elemendi aatomit molekulis on (indeksid). Molekuli­valem on omamoodi molekuli summaarne valem, mis saadakse struktuuri­valemis leiduvate aatomite kokku­lugemise tulemusel. Kui molekul sisaldab kaks või enam ühe ja sama keemilise elemendi aatomit, märgitakse nende arv indeksiga elemendi tähise järele. Näiteks äädik­happe molekuli­valem on C2H4O2, tavalise laua­suhkru molekuli­valem on C12H22O11.

Molekulivalem ei kirjelda molekuli struktuuri ega aatomite­vahelisi keemilisi sidemeid.

Molekuli struktuuri­valem (vasakul) ja molekuli­valem ehk summaarne valem (paremal)
Äädikhappe struktuuri­valem (vasakul) ja molekuli­valem ehk summaarne valem (paremal)
Lauasuhkru ehk sahharoosi molekuli kuul-pulk­mudel arvuti­programmis (vasakul), struktuuri­valem (keskel) ja molekuli­valem (paremal)
        • näitab, kuidas aatomid on molekulis omavahel seotud
        • kirjeldab molekuli koostist
        • keemilised sidemed tähistatakse kriipsudena
        • molekuli summaarne valem
        • aatomeid tähistatakse vastavate elementide tähistega
        • näitab, millised keemilised sidemed aatomeid ühendavad
        • näitab, kui paljudest aatomitest molekul koosneb
        • aatomite arv molekulis märgitakse alaindeksiga
        • ei kirjelda molekuli struktuuri ega keemilisi sidemeid aatomite vahel

        Struktuurivalem

        Molekulivalem

        • C6H14O2
        • C4H10
        • C4H8
        • C3H8
        • C6H12O2
        • C5H12

        Ma tean, et...

        • Molekulimudel on kolme­mõõtmeline molekuli kujutis, mis kirjeldab aatomite paiknemist molekulis (nt ruumiline mudel ja kuul-pulk­mudel).
        • Struktuurivalem on kahe­mõõtmeline üles­kirjutus, mis näitab, kuidas aatomid on molekulis oma­vahel seotud ja millised keemilised sidemed neid ühendavad.
        • Molekulivalem on üles­kirjutus, mis näitab, millistest keemilise elemendi aatomitest molekul koosneb (elementide tähised) ja mitu iga elemendi aatomit molekulis on (indeksid).

        Küsimused

        1. Miks on vaja teada aine ehitust?
        2. Mis on mudel?
        3. Mida kirjeldab molekulimudel?
        4. Nimeta molekulimudeleid. Mille poolest need üks­teisest erinevad?
        5. Miks kasutatakse molekuli struktuuri kirjeldamiseks sageli struktuuri­valemit, mitte molekuli­mudelit?
        6. Seleta, mille poolest erinevad struktuuri­valem ja molekuli­valem.